MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 1912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014911	CGT	2	6	40106	40111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765106
1002	NC_014911	GTC	2	6	40161	40166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765106
1003	NC_014911	GAT	2	6	40182	40187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765106
1004	NC_014911	GAA	2	6	40194	40199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765106
1005	NC_014911	CTCG	2	8	40262	40269	0 %	25 %	25 %	50 %	319765106
1006	NC_014911	GCGT	2	8	40298	40305	0 %	25 %	50 %	25 %	319765106
1007	NC_014911	CT	3	6	40440	40445	0 %	50 %	0 %	50 %	319765106
1008	NC_014911	GC	3	6	40449	40454	0 %	0 %	50 %	50 %	319765106
1009	NC_014911	CGT	2	6	40516	40521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765107
1010	NC_014911	GC	3	6	40556	40561	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
1011	NC_014911	ATC	2	6	40618	40623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765107
1012	NC_014911	CCCCG	2	10	40637	40646	0 %	0 %	20 %	80 %	319765107
1013	NC_014911	CGA	2	6	40679	40684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765107
1014	NC_014911	CG	3	6	40712	40717	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
1015	NC_014911	TCA	2	6	40751	40756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765107
1016	NC_014911	CAC	2	6	40917	40922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765107
1017	NC_014911	CG	3	6	40959	40964	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
1018	NC_014911	CAA	2	6	40968	40973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765107
1019	NC_014911	CGA	2	6	40991	40996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765107
1020	NC_014911	GTG	2	6	41023	41028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765107
1021	NC_014911	CGC	2	6	41051	41056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765107
1022	NC_014911	GTT	2	6	41061	41066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765107
1023	NC_014911	CG	3	6	41118	41123	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
1024	NC_014911	TGA	2	6	41213	41218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765107
1025	NC_014911	CG	3	6	41233	41238	0 %	0 %	50 %	50 %	319765107
1026	NC_014911	TTC	2	6	41302	41307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765107
1027	NC_014911	TCG	2	6	41378	41383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765108
1028	NC_014911	GCGA	2	8	41425	41432	25 %	0 %	50 %	25 %	319765108
1029	NC_014911	CCG	2	6	41433	41438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765108
1030	NC_014911	ACC	2	6	41460	41465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765108
1031	NC_014911	AGCC	2	8	41531	41538	25 %	0 %	25 %	50 %	319765108
1032	NC_014911	CGA	2	6	41574	41579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765108
1033	NC_014911	CGG	2	6	41636	41641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765108
1034	NC_014911	GCG	2	6	41675	41680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765108
1035	NC_014911	AGC	2	6	41735	41740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765108
1036	NC_014911	AGAT	2	8	41801	41808	50 %	25 %	25 %	0 %	319765108
1037	NC_014911	GTCGA	2	10	41819	41828	20 %	20 %	40 %	20 %	319765108
1038	NC_014911	GCC	2	6	41845	41850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765108
1039	NC_014911	CGA	2	6	41865	41870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765108
1040	NC_014911	GGCG	2	8	41908	41915	0 %	0 %	75 %	25 %	319765108
1041	NC_014911	TGC	2	6	41918	41923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765108
1042	NC_014911	CTTG	2	8	41929	41936	0 %	50 %	25 %	25 %	319765108
1043	NC_014911	TCC	2	6	41972	41977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319765108
1044	NC_014911	GCT	2	6	42070	42075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1045	NC_014911	TGC	2	6	42090	42095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1046	NC_014911	CGC	2	6	42104	42109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765109
1047	NC_014911	CAA	2	6	42110	42115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319765109
1048	NC_014911	CCA	2	6	42139	42144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765109
1049	NC_014911	GGC	2	6	42171	42176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765109
1050	NC_014911	GAT	2	6	42204	42209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765109
1051	NC_014911	CGC	2	6	42269	42274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765109
1052	NC_014911	TCA	2	6	42275	42280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765109
1053	NC_014911	GGCGA	2	10	42330	42339	20 %	0 %	60 %	20 %	319765109
1054	NC_014911	AGC	2	6	42439	42444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1055	NC_014911	TCA	2	6	42473	42478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765109
1056	NC_014911	GAT	3	9	42549	42557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765109
1057	NC_014911	GC	4	8	42576	42583	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
1058	NC_014911	CG	3	6	42660	42665	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
1059	NC_014911	GCCG	2	8	42666	42673	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
1060	NC_014911	AGGC	2	8	42724	42731	25 %	0 %	50 %	25 %	319765109
1061	NC_014911	GAA	3	9	42794	42802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765109
1062	NC_014911	CG	3	6	42854	42859	0 %	0 %	50 %	50 %	319765109
1063	NC_014911	ACG	2	6	42877	42882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1064	NC_014911	CAG	2	6	42919	42924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1065	NC_014911	GAT	2	6	42946	42951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765109
1066	NC_014911	ACG	2	6	42962	42967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765109
1067	NC_014911	CTT	2	6	42989	42994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765109
1068	NC_014911	AAG	2	6	43046	43051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319765110
1069	NC_014911	TTG	2	6	43185	43190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765110
1070	NC_014911	GCA	2	6	43378	43383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765110
1071	NC_014911	CAC	3	9	43445	43453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765110
1072	NC_014911	CTTG	2	8	43459	43466	0 %	50 %	25 %	25 %	319765110
1073	NC_014911	AGC	2	6	43469	43474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765110
1074	NC_014911	GCC	2	6	43490	43495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765110
1075	NC_014911	CAGCG	2	10	43541	43550	20 %	0 %	40 %	40 %	319765110
1076	NC_014911	CGGC	2	8	43605	43612	0 %	0 %	50 %	50 %	319765110
1077	NC_014911	GATCAA	2	12	43657	43668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319765110
1078	NC_014911	CGG	2	6	43707	43712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014911	A	6	6	43751	43756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014911	GTC	2	6	43851	43856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014911	ACA	2	6	43868	43873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014911	CGC	2	6	43914	43919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_014911	CGC	2	6	43969	43974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_014911	CAG	3	9	44089	44097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765111
1085	NC_014911	CGC	2	6	44136	44141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765111
1086	NC_014911	TCA	2	6	44316	44321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765112
1087	NC_014911	GTG	2	6	44376	44381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319765112
1088	NC_014911	TCA	2	6	44418	44423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765112
1089	NC_014911	GCA	2	6	44431	44436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765112
1090	NC_014911	CGG	2	6	44539	44544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765112
1091	NC_014911	TGT	2	6	44640	44645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014911	GAC	2	6	44657	44662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014911	GCG	2	6	44695	44700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_014911	GGC	2	6	44759	44764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014911	GCC	2	6	44769	44774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_014911	GCC	2	6	44812	44817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_014911	TCG	2	6	44872	44877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_014911	GCG	2	6	44899	44904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014911	TGC	2	6	44974	44979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_014911	A	7	7	45039	45045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014911	GCC	2	6	45046	45051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014911	GGC	2	6	45061	45066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014911	G	6	6	45081	45086	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014911	GTC	2	6	45111	45116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765113
1105	NC_014911	TCG	2	6	45157	45162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765113
1106	NC_014911	CTT	2	6	45189	45194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765113
1107	NC_014911	AGT	2	6	45272	45277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765113
1108	NC_014911	CG	3	6	45289	45294	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
1109	NC_014911	CAC	2	6	45357	45362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319765113
1110	NC_014911	GCCG	2	8	45452	45459	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
1111	NC_014911	GTA	2	6	45525	45530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765113
1112	NC_014911	TTGA	2	8	45538	45545	25 %	50 %	25 %	0 %	319765113
1113	NC_014911	TCG	4	12	45643	45654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765113
1114	NC_014911	GC	3	6	45655	45660	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
1115	NC_014911	TTG	2	6	45694	45699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319765113
1116	NC_014911	GCGCG	2	10	45725	45734	0 %	0 %	60 %	40 %	319765113
1117	NC_014911	CTT	2	6	45741	45746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765113
1118	NC_014911	CTG	2	6	45852	45857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765113
1119	NC_014911	CCG	2	6	45916	45921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765113
1120	NC_014911	CTT	2	6	45930	45935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319765113
1121	NC_014911	ACT	2	6	45948	45953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319765113
1122	NC_014911	GC	3	6	45971	45976	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
1123	NC_014911	CGG	2	6	46001	46006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765113
1124	NC_014911	GGC	2	6	46018	46023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765113
1125	NC_014911	GC	3	6	46035	46040	0 %	0 %	50 %	50 %	319765113
1126	NC_014911	CGG	2	6	46082	46087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765113
1127	NC_014911	CGG	2	6	46110	46115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765113
1128	NC_014911	GCC	2	6	46120	46125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765113
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1130	NC_014911	CGG	2	6	46166	46171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765113
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1245	NC_014911	CG	3	6	50847	50852	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1246	NC_014911	GCC	2	6	50889	50894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765119
1247	NC_014911	GCGCA	2	10	51012	51021	20 %	0 %	40 %	40 %	319765119
1248	NC_014911	GCG	2	6	51058	51063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765119
1249	NC_014911	CG	3	6	51062	51067	0 %	0 %	50 %	50 %	319765119
1250	NC_014911	TGA	2	6	51220	51225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319765119
1251	NC_014911	TGC	2	6	51253	51258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765119
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1380	NC_014911	CGT	2	6	56388	56393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319765125
1381	NC_014911	AGCCC	2	10	56407	56416	20 %	0 %	20 %	60 %	319765125
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1496	NC_014911	GCC	2	6	60190	60195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319765130
1497	NC_014911	GCG	2	6	60196	60201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319765130
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1500	NC_014911	CT	4	8	60448	60455	0 %	50 %	0 %	50 %	319765131

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